Se dit d’un orgue placé dans ou à proximité du chœur d’une église. On le distingue souvent du grand orgue placé en hauteur sur une tribune, un jubé ou en nid d’hirondelle. L’orgue de chœur sera de taille plus réduite et est destiné aux cérémonies plus intimes. Il peut, à l’occasion, alterner avec le grand orgue et accompagner le chœur de chanteurs.